Durante el siglo XVI (1534 hasta 1599) no hay ni rastros materiales de que haya existido el hoy llamado Belén.
En 1612, en las actas del Cabildo de Quito aparece una licencia que concede a unos vecinos un solar para poner una cruz.
Probablemente, señalan los historiadores que ellos construyeron la primera capilla de El Belén.
En 1618 aparece una Hermandad de Mercaderes tratando de revivir el pronto abatido calvario de los “vecinos” y a aquellos se les adosan los padres agustinos tratando de fundar ahí un convento, sin lograrlo.
En 1640, los padres mercedarios intentaron también fundar una recolección “Santa Cruz de El Belén”, pero fallaron.
En el año de 1694, el Obispo de Quito, Sancho de Andrade, manda a derrocar las ruinas de dicha ermita.
En 1789, el presidente Juan José de Villalengua reconstruyó la iglesia.
Archivo histórico del Banco Cenral del Ecuador – 80.F0000.0473.tif
