Los 16 clubes afiliados a la AFE están distribuidos en cuatro grupos, las ubicaciones de los equipos se las hizo al azar, a excepción de los que ocuparon los cuatro primeros lugares en el torneo del año 2018.
Fue así que Brasilia, campeón del 2018, lideró el grupo A, en el cual cayeron, Juventus, Centro Juvenil Deportivo y Esmeraldas F.C. Rocafuerte fue vicecampeón, encabezó la llave B, que lo integran además, Alianza del Pailón, Quinindé S.C. y Unión Deportivo Juvenil de Quinindé (UDJ-Q).
El grupo C lo comanda Atlético Quinindé, que fue tercero el año anterior, también están, Atacames, La Provincia y Vargas Torres. 5 de Agosto fue cuarto en el 2018, lideró el grupo D, tiene como acompañantes a Valencia, Esmeraldas Petrolero y Esmeraldas S.C.